在关雪与宋卓武的回忆中，《哈尔滨一九四四》呈现了一段逃难历程。两人在残酷现实之中挣扎求生，甚至不得不从堆满尸体的万人坑爬出来。正是卓武，这位哥哥，在危急关头返回，将关雪和弟弟救离险境。

故事似乎暗示着，兄妹三人在逃亡时曾一度分离，而卓武始终承担着保护关雪姐弟的责任。随着相处的加深，他与关雪的关系变得亲密。而命运并未就此善待他们，卓武随后被捕入狱。面对生存压力，关雪不得不投奔姨夫，成为特务，为了训练而远赴日本。可以想见，在那里她饱受折磨，如此遭遇使她精神愈发不稳定。

这一切都发生在风雨飘摇的1944年哈尔滨。那年，城市经历大规模轰炸，学生们被迫学习日语，731部队的残忍实验不断发生，特务科的所有成员似乎都在为自己的安全和前途盘算着，时时处在恐惧与警觉之中。

在这样的环境下，很难有人保持正常。特务科的人多数并不寻常，尤其是关雪。每当她情绪失控，众人无不提心吊胆。表面上的强势不过是伪装，实际上关雪内心极度脆弱，经常恐惧地躲进柜子，脑中不断闪现逃亡的记忆。工作中，那些大声叫喊，不过是尽力营造气势，她的病态并非假装。

她追求的只是能与弟弟相依为命，为此做出了极端选择。对身边人，她毫不手软，甚至拒绝让任何人威胁到自己的地位。宋卓文或许是唯一的例外，但她始终未曾完全信任他，总在试探和防范。例如她洗头时，卓文取走她的钥匙，她很可能早就察觉了。

剧集的13、14集中，崔安平揭开了宋卓文、宋卓武的双胞胎身份，并试图两边渔利。他分别向关雪和卓文索要钱财，做着一夜暴富的美梦。其妻子戏言：“和你在一起，要能活到年底都算喜事！”虽然他的结局注定凶险，但起伏过程颇为刺激。随着事态发展，卧底身份会被揭开，宋卓文也将受到怀疑。这时关雪问卓文：“如果你们赢了，你会放过我吗？”

关雪是否属于“黑化”其实并不明确。她更倾向于徘徊在灰色地带。对卓文始终秉持怀疑，尽管未曾亲自动手，或许倾向于为自己留一条退路，希望卓文念及过往情感，再次救她。她总觉得对方变得陌生，和以往并不是同一个人，这种难以言说的直觉，她一直无法摆脱。关雪这个角色颇为复杂，结局注定走向悲剧。

当夜，她的弟弟打算炸掉伪满的办公楼。此前，他已经击毙了一名日本人。同行者是一名军统成员，也极具个人作风。九个案件的线索尚未结束，后续还将触及731部队。潘越则悄悄就医，还隐藏了体检结果，显然是在防备被送去人体实验。卓文与卓武两条线索麻烦不断，兄弟将如何应对险境，令人期待。